中心实行校、院两级管理，结合临床技能实验教学的特点，先后制订了《临床技能培训中心规章制度》、《临床技能培训中心主任职责》、《临床技能培训中心实验教师职责》、《实验室学生守则》、《精密仪器管理办法》、《实验室开放使用规章制度》等规章制度，使实验教学各环节规范、严谨、运行顺畅。

中心实施分层、分级的考评方法以实施对中心各级人员的管理。按照学校的要求和规定中心根据制定的各级人员岗位职责进行考核和管理；还制定了各级人员培养计划和要求，对各级人员（特别是青年教师）进行政治素质及业务能力的培养及考核；根据课程设置和教学内容制定各教学环节的考核标准，规范教学过程。

中心以全面提高教学质量为目标，以人才培养目标和教学环节质量标准为依据，构建了由信息收集、分析与评价、反馈等组成的教学质量监控体系。一是制定“临床技能实验教学中心教学质量保障与监控实施方案”对教学过程进行全程监控，主要包括对教师“教”和学生“学”各环节的监控；二是制定教学各环节的质量标准和考核标准，统一临床技能操作规程，规范教学过程；三是实施教学质量监控措施，完善“四级评教”制度，即领导、专家、同行和学生评教；四是对教学各环节的质量分析，通过课后对教学各环节进行质量分析，不断改进教学中存在问题，提高教学质量。